気功は幅広い効能が得られる一方で、副作用が出る場合があるので気を付けなければならない。
「よく発生する異常反応をまとめて述べると次のようになる。 ①めまい、頭痛、頭が重い。 ②胸苦しさ、胸痛、両脇痛。 ③腹部膨満、腹筋のだるさ。 ④動悸。 ⑤腰、背中が凝っていて痛む。 ⑥体の冷え。 ⑦丹田の過熱、身体の過熱、口が渇く。 ⑧身体が揺れ動く。 ⑨疲労感。 ⑩暫時失眠。 異常が反応が現れるのは、そのほとんどが練功が不適当なためであり、正しく対処しなければならない。」（引用：『気功医学』/伊藤鉄民 P202）